Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms