Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Mrpl40Q9Z2Q5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Mrpl40Q9Z2Q5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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