Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms