Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Crlf3Q9Z2L7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms