Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms