Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms