Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms