Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D6

Mecp2, Methyl-CpG-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mecp2Q9Z2D6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms