Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka4Q9Z2B9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms