Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms