Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms