Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms