Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms