Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms