Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek4Q9Z1J2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek4Q9Z1J2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms