Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfkbiaQ9Z1E3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms