Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms