Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Sh3bp5Q9Z131 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Sh3bp5Q9Z131 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Sh3bp5Q9Z131 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Sh3bp5Q9Z131 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Sh3bp5Q9Z131 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp5Q9Z131 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp5Q9Z131 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp5Q9Z131 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp5Q9Z131 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp5Q9Z131 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5Q9Z131 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5Q9Z131 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5Q9Z131 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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