Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms