Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn9Q9Z0S7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn9Q9Z0S7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn9Q9Z0S7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn9Q9Z0S7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn9Q9Z0S7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn9Q9Z0S7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn9Q9Z0S7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn9Q9Z0S7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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