Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn13Q9Z0S4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn13Q9Z0S4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn13Q9Z0S4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn13Q9Z0S4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms