Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec2Q9WV35 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms