Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnip1Q9WUU8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnip1Q9WUU8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms