Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pfdn5Q9WU28 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pfdn5Q9WU28 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pfdn5Q9WU28 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pfdn5Q9WU28 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pfdn5Q9WU28 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pfdn5Q9WU28 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pfdn5Q9WU28 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pfdn5Q9WU28 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pfdn5Q9WU28 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pfdn5Q9WU28 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Pfdn5Q9WU28 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Pfdn5Q9WU28 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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