Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms