Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggps1Q9WTN0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms