Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spo11Q9WTK8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms