Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TapbpQ9R233 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms