Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms