Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b2Q9R0K7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b2Q9R0K7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms