Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms