Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc3Q9R0B6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms