Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms