Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms