Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp11cQ9QZW0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms