Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms