Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms