Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2afyQ9QZQ8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afyQ9QZQ8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms