Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms