Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms