Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms