Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Opn4Q9QXZ9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Opn4Q9QXZ9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Opn4Q9QXZ9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Opn4Q9QXZ9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Opn4Q9QXZ9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Opn4Q9QXZ9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Opn4Q9QXZ9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Opn4Q9QXZ9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms