Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms