Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf3Q9QXK7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms