Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms