Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms