Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trim44Q9QXA7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms