Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms