Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a1Q9QX15 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms