Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdcQ9QW08 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdcQ9QW08 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms